Stage analyse génomique et protéomique de bactéries stimulant la croissance des plantes

8046 Zürich | 100-100%

****Ce à quoi vous pouvez contribuer****

• Soutien à l'analyse des données protéomiques microbiennes; intégration avec les données de séquençage génomique
• Soutien à l'assemblage du génome bactérien à partir de données de séquençage de nouvelle génération (Illumina, PacBio, ONT)
• Aide supplémentaire pour l'analyse d'autres données OMICS (RNA-Seq, Tn-Seq)
• Contributions aux projets de recherche (y compris les publications) de l'équipe \
• Participation à la maintenance et à l'extension des fonctionnalités des pipelines d'analyse de données existants (protéomique, assemblage du génome)

****Ce qui vous rend unique****

• Diplôme de master obtenu récemment (il y a moins de 10 mois) (université, EPF, HES)
• Chercheur/chercheuse motivé, possédant une expérience et un diplôme en biologie computationnelle/bio-informatique
• Très bonnes compétences en programmation (Python/R); une expérience dans le domaine de l'analyse des données de génomique fonctionnelle est un atout
• Esprit d'équipe prononcé et bonne aptitude à communiquer
• Connaissances de deux langues officielles et de l'anglais

****En quelques mots****

Nous recherchons une personne motivée et engagée, qui aime analyser et intégrer des données de génomique fonctionnelle (principalement des données de séquençage du génome et de protéomique, ainsi que, le cas échéant, des données RNA-seq et Tn-seq) et qui contribue à la compréhension des mécanismes permettant aux bactéries, d'une part, de stimuler la croissance des plantes et, d'autre part, d'empêcher la croissance d'agents pathogènes végétaux nuisibles. Nous offrons un environnement varié et international, un bon esprit d'équipe et une recherche innovante et orientée vers la pratique.

****Ce que nous offrons****

• Travailler pour la Suisse Nous nous engageons pour le succès du modèle suisse et pour le bien-être de la population.
• La diversité au quotidien Nous veillons à l'égalité des chances, qui nous permet de déployer nos compétences et d'exprimer des points de vue différents.
• Santé au travail Nous assistons et conseillons nos collaboratrices et collaborateurs pour toutes les questions liées à la santé physique ou psychique.

Tous les avantages

****Une bonne alimentation, un environnement sain****

Agroscope est le centre de compétences de la Confédération pour la recherche dans les domaines de l'agriculture et de la filière alimentaire. Les chercheuses et chercheurs exercent leurs activités sur divers sites en Suisse. Le siège principal se trouve à Berne-Liebefeld (à partir de 2026: Posieux FR). Agroscope est rattaché au Département fédéral de l'économie, de la formation et de la recherche DEFR.

****Informations complémentaires****

En tant qu'éléments constitutifs de la biodiversité et grâce à leurs diverses fonctions, tous les êtres vivants contribuent au bon fonctionnement et à la stabilité des écosystèmes. Bon nombre de leurs caractéristiques sont déterminées par leur patrimoine génétique. Le groupe de recherche Agroécologie et phytoécologie moléculaire mène et soutient des projets de recherche scientifique sur la diversité génétique et génomique en utilisant les approches les plus modernes en biologie moléculaire, en bio-informatique et en biostatistique. L'équipe Génomique microbienne et bio-informatique du site de Reckenholz travaille avec des données de génomique fonctionnelle de pointe. Elle s'est fixée pour objectif de développer des outils logiciels et de mener des recherches qui aident les chercheurs à intégrer progressivement les résultats de la recherche fondamentale dans des applications pratiques, générant ainsi une valeur ajoutée pour la recherche appliquée.

****Questions sur le poste****

Christian Ahrens Responsable de l'équipe Génomique microbienne et bio-informatique
+41 58 46 06114